一、變化
1.人員結(jié)構(gòu)調(diào)整為“企業(yè)從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)的科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)比例不低于10%”，同時(shí)也取消了學(xué)歷的限制。
2.降低了年收入小于5千萬(wàn)元的企業(yè)收取對(duì)于研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用總額占銷(xiāo)售收入總額的比例，由原來(lái)的6%降到5%，降了1%。
3.取消了“近三年內(nèi)獲得知識(shí)產(chǎn)權(quán)的限制”和“五年以上獨(dú)占許可獲得知識(shí)產(chǎn)權(quán)的方式”，但同時(shí)明確了知識(shí)產(chǎn)權(quán)必須是對(duì)企業(yè)主導(dǎo)產(chǎn)品在技術(shù)上發(fā)揮核心支持的作用。
4.雖然還是八大技術(shù)領(lǐng)域，但也擴(kuò)充了航天、服務(wù)業(yè)和文化產(chǎn)業(yè)的支撐技術(shù)，取消了功能食品和農(nóng)產(chǎn)品深加工的產(chǎn)品。
5.取消了對(duì)高新技術(shù)企業(yè)的復(fù)審決定，要求在每年5月底前在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”填報(bào)上一年發(fā)展情況報(bào)表。
6.公示時(shí)間有原來(lái)的15個(gè)工作日改為10個(gè)工作日，企業(yè)更名不再報(bào)領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案，增加涉密企業(yè)認(rèn)定和異地搬遷企業(yè)資質(zhì)互認(rèn)。
7.明確了采用備案與跟蹤監(jiān)管、隨機(jī)抽查與重點(diǎn)檢查相結(jié)合的方式加強(qiáng)檢查。

二、企業(yè)費(fèi)用
1.參考計(jì)扣除放寬研發(fā)費(fèi)用的核算口徑，新增五險(xiǎn)一金、創(chuàng)新設(shè)計(jì)活動(dòng)發(fā)生的相關(guān)費(fèi)用、新藥臨床試驗(yàn)費(fèi)、探開(kāi)發(fā)技術(shù)的現(xiàn)場(chǎng)試驗(yàn)費(fèi)、田間試驗(yàn)費(fèi)等。
2.其它費(fèi)用比例由原來(lái)的不超過(guò)10%提高到不超過(guò)20%。
3.明確刪除了“與其他任職或受雇有關(guān)的其他支出，辦公費(fèi)”等概念廣泛、不確定的內(nèi)容。
4.研發(fā)經(jīng)費(fèi)占比從3%、4%、6%變?yōu)?%、4%、5%，向中小企業(yè)傾斜。

三、注意事項(xiàng)
1.申報(bào)企業(yè)：申報(bào)企業(yè)必須是法人企業(yè)，所提供的財(cái)務(wù)報(bào)表不應(yīng)含有下屬企業(yè)的合并報(bào)表，其他資料也不應(yīng)含有下屬法人企業(yè)的相關(guān)資料，個(gè)人獨(dú)資企業(yè)、合伙企業(yè)不在申報(bào)范圍內(nèi)。
2.知識(shí)產(chǎn)權(quán)：企業(yè)申報(bào)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)權(quán)屬人必須是申報(bào)企業(yè)，企業(yè)通過(guò)受讓、受贈(zèng)、并購(gòu)的方式獲得的知識(shí)產(chǎn)權(quán)必須提供相關(guān)的主管部門(mén)出具的變更證明，其有效期必須覆蓋高新技術(shù)企業(yè)有效期。
3.中介機(jī)構(gòu)：參與企業(yè)研發(fā)費(fèi)用、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)的中介機(jī)構(gòu)應(yīng)提供其服務(wù)符合《認(rèn)定指引》中相關(guān)規(guī)定的證明和承諾書(shū)，據(jù)實(shí)出具專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)或鑒定報(bào)告，并對(duì)企業(yè)研發(fā)費(fèi)用、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況及相關(guān)編制說(shuō)明發(fā)表明確意見(jiàn)。
4.申報(bào)材料的完整性以及相關(guān)信息的一致性。